主要分为医用类多肽药物  ，肽类抗生素  ，疫苗  ，农用类抗菌肽  ，饲料小肽  ，日化用化妆品  ，食品用大豆多肽  ，玉米多肽  ，酵母多肽  ，海参肽 。

从功能角度来分  ，可以分为降压肽  ，抗氧化肽  ，降胆固醇肽  ，类鸦片活性肽  ，高F值寡肽  ，食品强味肽等等 。

活性肽  ，与营养  ，荷尔蒙、酵素抑制、调节免疫、抗菌、抗病毒、抗氧化有非常紧密关系 。多肽大体上分为：多肽类药物和多肽类保健品 。传统的多肽类药物主要是多肽类激素  ，对多肽类药物的开发已经发展到疾病防治的各个领域  ，特别是在以下各领域发展较快 。